1、接種前準備：
菌種培養構築物的選擇：方便操作，有抽汙泥曝氣裝置，有攪拌，利於加菌種、進原水或營養液的構築物。菌種在抽污泥投加時，方案設定應根據現場具備的條件綜合考慮。如場地、施工、運輸車輛、臨時電源、臨時泵及管道、水槍、高差、過濾等因素。菌種的粉碎對於壓縮污泥應考慮污泥的粉碎問題，應根據現場的條件確定粉碎方法。粉碎方法選擇的順序為水槍——泵循環+濾網沖擊——曝氣、攪拌。2、接種量的多少：厭氧污泥接種量一般不應少於水量的8-10%，否則，將影響啟動速度；好氧污泥接種量一般應不少於水量的 5%。
只要按照規範施工，厭氧、好氧菌可在規定範圍正常啟動。3、抽污泥來源：厭氧污泥主要來源於已有的厭氧工程，如啤酒厭氧發酵工程、農村沼氣池、魚塘、泥塘、護城河清淤污泥；好氧污泥主要來自城市污水處理廠，應拉取當日脫水的活性污泥作為好氧菌種，接種污泥且按此順序確定優先級。1、同類污水廠的剩餘污泥或脫水污泥；2、城市污水廠的剩餘污泥或脫水污泥；3、其它不同類污水站的剩餘污泥或脫水污泥；4、河流或湖泊底部污泥；5、糞便污泥上清液。
二、活性污泥啟動
應特別說明，菌種、水溫及水質條件，是影響啟動周期長短的重要條件。一般來講，在低於20℃的條件下，接種和啟動均有一定的困難，特別是冬季運行時更是如此。因此，建議冬季運行時污泥分兩次投加，水解酸化池中活性污泥投加比例8%（濃縮污泥），曝氣池中活性污泥的投加比例為10﹪（濃縮污泥，乾污泥為8%），在不同的溫度條件下，投加的比例不同。
投加後按正常水位條件，連續悶曝（曝氣期間不進水）7天后，檢查處理效果，在確定微生物生化條件正常時，方可小水量連續進水25天，待生化效果明顯或氣溫明顯回升時，再次向兩池分別投加10﹪活性污泥，生化工藝才能正常啟動。
三、污泥馴化
污泥馴化應遵循的原則循序漸進、有的放矢、精心控制的。污泥馴化的方法與技巧如果培養期間加入的主要是生活污水，這個時候逐步降低生活污水的加入量，並逐步增加原水的進水量，每次增加的進水量為設計進水量的5~10%，每增加一次應穩定2~3個周期或2天左右，發現系統內或出水指標上升應繼續維持本次進水量，直至出水指標穩定，如出水指標一直上升，應暫停進水，待指標恢復正常後，進水量應稍微減少，或略大於上周期進水量。
馴化條件具備後，連續運行已見到效果的情況下，採用遞增污水進水量的方式，使微生物逐步適應新的生活條件，遞增幅度的大小按厭氧、好氧工藝及現場條件有所不同。以此類推，最終達到系統設計符合。活性污泥馴化時，也可採用體積負荷法來進行馴化，可根據化驗數據、進水指標、系統指標、構築物體積推算出單位時間的系統污泥負荷，根據體積負荷來確定下個周期的進水量。
好氧正常啟動可在10-20天內完成，遞增比例為5-10%；而厭氧進水遞增比例則要小的很多，一般應控制揮發酸(VFA)濃度不大於1000mg/L，且厭氧池中PH值應保持在6.5-7.5範圍內，不要產生太大的波動，在這種情況下水量才可慢慢遞增。一般來講，厭氧從啟動到轉入正常運行（滿負荷量進水）需要3-6個月才能完成。
四、污泥培養
1、活性污泥培養過程中，應經常測定進水的pH、COD、氨氮和曝氣池溶解氧、污泥沉降性能等指標。活性污泥初步形成後，就要進行生物相觀察，根據觀察結果對污泥培養狀態進行評估，並動態調控培菌過程。
2、活性污泥的培養應盡可能在溫度適宜的季節進行。因為溫度適宜，微生物生長快，培菌時間短。如只能在冬季培菌，則應該採用接種培菌法，所需的種污泥要比春秋季多。
3、培菌過程中，特別是污泥初步形成以後，要註意防止污泥過度自身氧化，特別是在夏季。有不少廠都發生過此類情況。這不僅增加了培菌時間和費用，甚至會導致污水處理系統無法按期投入運行。要避免污泥自身氧化，控制曝氣量和曝氣時間是關鍵，要經常測定池內的溶解氧含量，要及時進水以滿足微生物對營養的需求。若進水濃度太低，則要投加大糞等以補充營養，條件不具備時可採用間歇曝氣。
4、活性污泥培菌後期，適當排出一些老化污泥有利於微生物進一步生長繁殖。
5、工業廢水處理廠在生產裝置投產前往往沒有廢水進入，而一旦生產裝置投產後，排放的廢水就需及時處理。此時，應根據實際情況合理確定培菌時間，並提前準備種污泥及養料等。
6、如曝氣池中污泥已培養成熟，但仍沒有廢水進入時，應停止曝氣使污泥處於休眠狀態，或間歇曝氣(延長曝氣間隔時間、減少曝氣量)，以盡可能降低污泥自身氧化的速度。有條件時，應投加大糞、無毒性的有機下腳料(如食堂泔腳)等營養物。
7、大部分的廢水處理廠都有二個(格)以上的曝氣池。這種情況下可先利用一隻曝氣池培養活性污泥，然後再輸送到相鄰其它曝氣池進行多級擴大培養。本法適用於規模較大的廢水處理廠。
